Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL9A3Q14050 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL9A3Q14050 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
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