Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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