Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF9Q13886 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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