Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTAN1Q13813 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms