Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTCH1Q13635 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
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