Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDH18Q13634 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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CDH18Q13634 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDH18Q13634 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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