Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATRQ13535 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATRQ13535 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATRQ13535 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRQ13535 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRQ13535 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRQ13535 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRQ13535 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRQ13535 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRQ13535 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRQ13535 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRQ13535 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRQ13535 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRQ13535 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRQ13535 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRQ13535 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRQ13535 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRQ13535 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRQ13535 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRQ13535 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRQ13535 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRQ13535 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRQ13535 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRQ13535 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRQ13535 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRQ13535 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRQ13535 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRQ13535 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRQ13535 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRQ13535 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRQ13535 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRQ13535 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRQ13535 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRQ13535 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRQ13535 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRQ13535 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRQ13535 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRQ13535 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRQ13535 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRQ13535 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRQ13535 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRQ13535 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRQ13535 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRQ13535 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRQ13535 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRQ13535 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRQ13535 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRQ13535 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRQ13535 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRQ13535 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRQ13535 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRQ13535 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRQ13535 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRQ13535 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRQ13535 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRQ13535 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRQ13535 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRQ13535 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRQ13535 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRQ13535 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRQ13535 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRQ13535 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRQ13535 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRQ13535 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRQ13535 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRQ13535 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRQ13535 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRQ13535 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRQ13535 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRQ13535 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRQ13535 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRQ13535 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRQ13535 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRQ13535 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRQ13535 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRQ13535 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRQ13535 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRQ13535 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRQ13535 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRQ13535 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRQ13535 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRQ13535 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRQ13535 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRQ13535 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRQ13535 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRQ13535 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRQ13535 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRQ13535 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRQ13535 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRQ13535 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRQ13535 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRQ13535 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRQ13535 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRQ13535 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRQ13535 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRQ13535 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRQ13535 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRQ13535 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRQ13535 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRQ13535 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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