Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PICALMQ13492 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
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