Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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PMS2P3Q13401 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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PMS2P3Q13401 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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