Protein–RNA interactions for Protein: Q13371

PDCL, Phosducin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCLQ13371 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCLQ13371 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms