Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLAMF1Q13291 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLAMF1Q13291 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLAMF1Q13291 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLAMF1Q13291 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLAMF1Q13291 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLAMF1Q13291 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLAMF1Q13291 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLAMF1Q13291 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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