Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLN3Q13286 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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