Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
PRKAA1Q13131 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKAA1Q13131 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms