Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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GPS1Q13098 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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GPS1Q13098 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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GPS1Q13098 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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GPS1Q13098 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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GPS1Q13098 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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GPS1Q13098 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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GPS1Q13098 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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GPS1Q13098 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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GPS1Q13098 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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GPS1Q13098 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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