Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRDNQ13061 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
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