Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ECH1Q13011 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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