Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
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FOXC1Q12948 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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FOXC1Q12948 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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FOXC1Q12948 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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FOXC1Q12948 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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FOXC1Q12948 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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FOXC1Q12948 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FOXC1Q12948 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FOXC1Q12948 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FOXC1Q12948 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
FOXC1Q12948 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
FOXC1Q12948 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXC1Q12948 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXC1Q12948 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXC1Q12948 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXC1Q12948 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXC1Q12948 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXC1Q12948 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXC1Q12948 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXC1Q12948 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXC1Q12948 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXC1Q12948 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXC1Q12948 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXC1Q12948 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXC1Q12948 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXC1Q12948 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXC1Q12948 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXC1Q12948 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXC1Q12948 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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