Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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PTPN13Q12923 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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PTPN13Q12923 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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PTPN13Q12923 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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PTPN13Q12923 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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PTPN13Q12923 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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PTPN13Q12923 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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PTPN13Q12923 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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PTPN13Q12923 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
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PTPN13Q12923 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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