Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC173Q0VFZ6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms