Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms