Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 DNL4YOR005C 2835 nt2.75□□□□□ -1.97
SGO1Q08490 NAB3YPL190C 2409 nt2.74□□□□□ -1.97
SGO1Q08490 YIL032CYIL032C 357 nt2.74□□□□□ -1.97
SGO1Q08490 RPA34YJL148W 702 nt2.74□□□□□ -1.97
SGO1Q08490 LSM7YNL147W 348 nt2.74□□□□□ -1.97
SGO1Q08490 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt2.74□□□□□ -1.97
SGO1Q08490 RPL33AYPL143W 324 nt2.74□□□□□ -1.97
SGO1Q08490 DIS3YOL021C 3006 nt2.74□□□□□ -1.97
SGO1Q08490 BAS1YKR099W 2436 nt2.74□□□□□ -1.97
SGO1Q08490 MPH1YIR002C 2982 nt2.74□□□□□ -1.97
SGO1Q08490 RLI1YDR091C 1827 nt2.73□□□□□ -1.97
SGO1Q08490 PSK2YOL045W 3306 nt2.73□□□□□ -1.97
SGO1Q08490 QCR7YDR529C 384 nt2.73□□□□□ -1.97
SGO1Q08490 YGR151CYGR151C 336 nt2.73□□□□□ -1.97
SGO1Q08490 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.73□□□□□ -1.97
SGO1Q08490 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt2.73□□□□□ -1.97
SGO1Q08490 YNL010WYNL010W 726 nt2.73□□□□□ -1.97
SGO1Q08490 FKS3YMR306W 5358 nt2.73□□□□□ -1.97
SGO1Q08490 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
SGO1Q08490 EMC6YLL014W 327 nt2.72□□□□□ -1.97
SGO1Q08490 SAR1YPL218W 573 nt2.72□□□□□ -1.97
SGO1Q08490 COG8YML071C 1824 nt2.72□□□□□ -1.97
SGO1Q08490 MMS1YPR164W 4224 nt2.72□□□□□ -1.97
SGO1Q08490 AI2Q0055 2565 nt2.71□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 NPR2YEL062W 1848 nt2.71□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.71□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 YHL041WYHL041W 450 nt2.71□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 PHS1YJL097W 654 nt2.71□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 GRX8YLR364W 330 nt2.71□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 FPR1YNL135C 345 nt2.71□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt2.71□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 PRP6YBR055C 2700 nt2.71□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 KAR3YPR141C 2190 nt2.71□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 HRD3YLR207W 2502 nt2.7□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 VTC3YPL019C 2508 nt2.7□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.7□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 YHL042WYHL042W 453 nt2.7□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 RPL36AYMR194W 303 nt2.7□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 MRPL33YMR286W 261 nt2.7□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 MMS22YLR320W 4365 nt2.7□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 NET1YJL076W 3570 nt2.69□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 ATG11YPR049C 3537 nt2.69□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 FIR1YER032W 2631 nt2.69□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 YGL024WYGL024W 336 nt2.69□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 RTC6YPL183W-A 282 nt2.69□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 RIM20YOR275C 1986 nt2.69□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 NCL1YBL024W 2055 nt2.69□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 SDC25YLL016W 3147 nt2.68□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 SUL1YBR294W 2580 nt2.68□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 YPR089WYPR089W 2667 nt2.68□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 VPS35YJL154C 2835 nt2.68□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 ATP8Q0080 147 nt2.68□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 YIL080WYIL080W 4722 nt2.68□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 KEL2YGR238C 2649 nt2.68□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 snR55snR55 98 nt2.67□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 YLR053CYLR053C 327 nt2.67□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 YNL338WYNL338W 159 nt2.67□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 PTC5YOR090C 1719 nt2.67□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 SOK2YMR016C 2358 nt2.67□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 UBP11YKR098C 2154 nt2.67□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 DUG2YBR281C 2637 nt2.67□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 KSP1YHR082C 3090 nt2.67□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 YBT1YLL048C 4986 nt2.67□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 CYR1YJL005W 6081 nt2.66□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 CAF120YNL278W 3183 nt2.66□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 RBK1YCR036W 1002 nt2.66□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 YIL174WYIL174W 228 nt2.66□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.66□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 YOR302WYOR302W 78 nt2.66□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 SSN2YDR443C 4263 nt2.66□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 ESC1YMR219W 4977 nt2.66□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 SGS1YMR190C 4344 nt2.65□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 YDR239CYDR239C 2364 nt2.65□□□□□ -1.98
SGO1Q08490 YGL069CYGL069C 465 nt2.65□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 RPS27AYKL156W 249 nt2.65□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 KTI11YBL071W-A 249 nt2.65□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 UBP15YMR304W 3693 nt2.64□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 SRO77YBL106C 3033 nt2.64□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 MVP1YMR004W 1536 nt2.64□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 snR60snR60 104 nt2.64□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 HYP2YEL034W 474 nt2.64□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 GPG1YGL121C 381 nt2.64□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 SMD1YGR074W 441 nt2.64□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 PTP3YER075C 2787 nt2.63□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt2.63□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt2.63□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.63□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 CRS5YOR031W 210 nt2.63□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 HHT1YBR010W 411 nt2.63□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 SGD1YLR336C 2700 nt2.63□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 DOT6YER088C 2013 nt2.63□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 GCV2YMR189W 3105 nt2.62□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 NPC2YDL046W 522 nt2.62□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 YRB1YDR002W 606 nt2.62□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.62□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt2.62□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 YPR063CYPR063C 423 nt2.62□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 GEA1YJR031C 4227 nt2.61□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 SNU114YKL173W 3027 nt2.61□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 PAU2YEL049W 363 nt2.61□□□□□ -1.99
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