Protein–RNA interactions for Protein: Q08054

CSI2, Chitin synthase 3 complex protein CSI2, yeastyeast

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSI2Q08054 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt1.1□□□□□ -2.23
CSI2Q08054 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt1.1□□□□□ -2.23
CSI2Q08054 YJR141WYJR141W 1044 nt1.1□□□□□ -2.23
CSI2Q08054 YKL111CYKL111C 336 nt1.1□□□□□ -2.23
CSI2Q08054 UBX4YMR067C 1251 nt1.1□□□□□ -2.23
CSI2Q08054 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt1.1□□□□□ -2.23
CSI2Q08054 NOT5YPR072W 1683 nt1.1□□□□□ -2.23
CSI2Q08054 RAD9YDR217C 3930 nt1.09□□□□□ -2.23
CSI2Q08054 KAR3YPR141C 2190 nt1.09□□□□□ -2.23
CSI2Q08054 IRC19YLL033W 693 nt1.09□□□□□ -2.23
CSI2Q08054 SEC22YLR268W 645 nt1.09□□□□□ -2.23
CSI2Q08054 BER1YLR412W 825 nt1.09□□□□□ -2.23
CSI2Q08054 PKR1YMR123W 369 nt1.09□□□□□ -2.23
CSI2Q08054 GPX2YBR244W 489 nt1.09□□□□□ -2.23
CSI2Q08054 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt1.09□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 PLC1YPL268W 2610 nt1.08□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 IRR1YIL026C 3453 nt1.08□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 snR84snR84 550 nt1.08□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 YER121WYER121W 345 nt1.08□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 RTT102YGR275W 474 nt1.08□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 YJR079WYJR079W 330 nt1.08□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 ILM1YJR118C 612 nt1.08□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 YML003WYML003W 873 nt1.08□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 CYB5YNL111C 363 nt1.08□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 VPS52YDR484W 1926 nt1.08□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 MNL2YLR057W 2550 nt1.07□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 SGD1YLR336C 2700 nt1.07□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 GIC1YHR061C 945 nt1.07□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 RPC10YHR143W-A 213 nt1.07□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 YKL044WYKL044W 321 nt1.07□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 CMC2YBL059C-A 330 nt1.07□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 RCN2YOR220W 798 nt1.07□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 SWT1YOR166C 1377 nt1.07□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 BST1YFL025C 3090 nt1.07□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 SNU56YDR240C 1479 nt1.06□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 snR79snR79 84 nt1.06□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 EMC4YGL231C 573 nt1.06□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 SVS1YPL163C 783 nt1.06□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 YSY6YBR162W-A 198 nt1.06□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 YBR224WYBR224W 516 nt1.06□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 COX1Q0045 1605 nt1.06□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 NOP53YPL146C 1368 nt1.06□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt1.06□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 YLR149CYLR149C 2193 nt1.06□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 TBS1YBR150C 3285 nt1.06□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 SPR3YGR059W 1539 nt1.05□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 CTR9YOL145C 3234 nt1.05□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt1.05□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 YBL083CYBL083C 426 nt1.05□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 IRC16YPR038W 360 nt1.05□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 SNF5YBR289W 2718 nt1.05□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 YSW1YBR148W 1830 nt1.05□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 ASM4YDL088C 1587 nt1.04□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 MET32YDR253C 576 nt1.04□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 SMB1YER029C 591 nt1.04□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 YER188C-AYER188C-A 300 nt1.04□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 CIC1YHR052W 1131 nt1.04□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt1.04□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.04□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.04□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 MCM22YJR135C 720 nt1.04□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 YLR140WYLR140W 327 nt1.04□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 YAR068WYAR068W 486 nt1.04□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 PGA1YNL158W 597 nt1.04□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 DAS1YJL149W 1992 nt1.04□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 TTI1YKL033W 3117 nt1.04□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 HIR3YJR140C 4947 nt1.04□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 SMY1YKL079W 1971 nt1.03□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 HMI1YOL095C 2121 nt1.03□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt1.03□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.03□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 IES5YER092W 378 nt1.03□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 TIF11YMR260C 462 nt1.03□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 PEP3YLR148W 2757 nt1.03□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 ZRG8YER033C 3231 nt1.03□□□□□ -2.24
CSI2Q08054 PPN1YDR452W 2025 nt1.03□□□□□ -2.25
CSI2Q08054 MSS11YMR164C 2277 nt1.03□□□□□ -2.25
CSI2Q08054 YCR043CYCR043C 384 nt1.02□□□□□ -2.25
CSI2Q08054 STE18YJR086W 333 nt1.02□□□□□ -2.25
CSI2Q08054 CTK3YML112W 891 nt1.02□□□□□ -2.25
CSI2Q08054 PET123YOR158W 957 nt1.02□□□□□ -2.25
CSI2Q08054 GAL7YBR018C 1101 nt1.02□□□□□ -2.25
CSI2Q08054 snR189snR189 189 nt1.02□□□□□ -2.25
CSI2Q08054 YPR153WYPR153W 423 nt1.02□□□□□ -2.25
CSI2Q08054 SLM6YBR266C 453 nt1.02□□□□□ -2.25
CSI2Q08054 IML1YJR138W 4755 nt1.02□□□□□ -2.25
CSI2Q08054 IRE1YHR079C 3348 nt1.01□□□□□ -2.25
CSI2Q08054 SHE9YDR393W 1371 nt1.01□□□□□ -2.25
CSI2Q08054 CRG1YHR209W 876 nt1.01□□□□□ -2.25
CSI2Q08054 YJL015CYJL015C 285 nt1.01□□□□□ -2.25
CSI2Q08054 HUG1YML058W-A 207 nt1.01□□□□□ -2.25
CSI2Q08054 YNL303WYNL303W 348 nt1.01□□□□□ -2.25
CSI2Q08054 RPL33BYOR234C 324 nt1.01□□□□□ -2.25
CSI2Q08054 YBR071WYBR071W 636 nt1.01□□□□□ -2.25
CSI2Q08054 ADR1YDR216W 3972 nt1□□□□□ -2.25
CSI2Q08054 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1□□□□□ -2.25
CSI2Q08054 APL1YJR005W 2103 nt1□□□□□ -2.25
CSI2Q08054 STF2YGR008C 255 nt1□□□□□ -2.25
CSI2Q08054 MAK10YEL053C 2202 nt1□□□□□ -2.25
CSI2Q08054 RSM22YKL155C 1887 nt0.99□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 46.1 ms