Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FMODQ06828 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FMODQ06828 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FMODQ06828 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FMODQ06828 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FMODQ06828 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FMODQ06828 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FMODQ06828 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FMODQ06828 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FMODQ06828 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FMODQ06828 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FMODQ06828 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FMODQ06828 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FMODQ06828 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FMODQ06828 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FMODQ06828 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FMODQ06828 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FMODQ06828 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FMODQ06828 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FMODQ06828 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FMODQ06828 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FMODQ06828 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FMODQ06828 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FMODQ06828 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FMODQ06828 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FMODQ06828 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FMODQ06828 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FMODQ06828 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FMODQ06828 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FMODQ06828 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FMODQ06828 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FMODQ06828 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FMODQ06828 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FMODQ06828 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FMODQ06828 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FMODQ06828 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FMODQ06828 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FMODQ06828 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FMODQ06828 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FMODQ06828 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FMODQ06828 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FMODQ06828 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FMODQ06828 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FMODQ06828 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FMODQ06828 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FMODQ06828 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FMODQ06828 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FMODQ06828 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FMODQ06828 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FMODQ06828 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FMODQ06828 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FMODQ06828 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FMODQ06828 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FMODQ06828 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FMODQ06828 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FMODQ06828 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FMODQ06828 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FMODQ06828 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FMODQ06828 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FMODQ06828 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FMODQ06828 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
FMODQ06828 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FMODQ06828 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FMODQ06828 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FMODQ06828 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
FMODQ06828 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FMODQ06828 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FMODQ06828 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FMODQ06828 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FMODQ06828 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FMODQ06828 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FMODQ06828 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FMODQ06828 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FMODQ06828 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FMODQ06828 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FMODQ06828 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FMODQ06828 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FMODQ06828 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FMODQ06828 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FMODQ06828 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FMODQ06828 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FMODQ06828 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FMODQ06828 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FMODQ06828 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FMODQ06828 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FMODQ06828 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FMODQ06828 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FMODQ06828 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FMODQ06828 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FMODQ06828 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FMODQ06828 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FMODQ06828 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FMODQ06828 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FMODQ06828 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FMODQ06828 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FMODQ06828 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FMODQ06828 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FMODQ06828 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FMODQ06828 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FMODQ06828 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms