Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC18A2Q05940 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC18A2Q05940 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC18A2Q05940 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC18A2Q05940 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A2Q05940 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A2Q05940 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A2Q05940 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A2Q05940 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A2Q05940 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A2Q05940 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A2Q05940 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A2Q05940 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A2Q05940 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A2Q05940 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A2Q05940 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A2Q05940 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A2Q05940 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A2Q05940 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A2Q05940 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A2Q05940 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A2Q05940 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A2Q05940 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC18A2Q05940 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC18A2Q05940 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC18A2Q05940 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC18A2Q05940 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC18A2Q05940 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC18A2Q05940 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC18A2Q05940 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC18A2Q05940 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC18A2Q05940 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC18A2Q05940 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms