Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3AQ05086 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms