Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ATP7AQ04656 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ATP7AQ04656 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms