Protein–RNA interactions for Protein: Q04368

CSI1, Cop9 signalosome-interactor 1, yeastyeast

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSI1Q04368 PBI2YNL015W 228 nt1.63□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 TOM22YNL131W 459 nt1.63□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 YPL068CYPL068C 882 nt1.63□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 CCH1YGR217W 6120 nt1.63□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 NUP120YKL057C 3114 nt1.62□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 RPL37AYLR185W 267 nt1.62□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 PET123YOR158W 957 nt1.62□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 SPC29YPL124W 762 nt1.62□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 ROX1YPR065W 1107 nt1.62□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 RKM1YPL208W 1752 nt1.62□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 CDC25YLR310C 4770 nt1.62□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 YOR019WYOR019W 2193 nt1.61□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 MUD2YKL074C 1584 nt1.61□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 KCS1YDR017C 3153 nt1.61□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 YDL041WYDL041W 354 nt1.61□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 MXR1YER042W 555 nt1.61□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 VOA1YGR106C 798 nt1.61□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 HSK3YKL138C-A 210 nt1.61□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 PGA1YNL158W 597 nt1.61□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 SNC2YOR327C 348 nt1.61□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 YLR419WYLR419W 4308 nt1.6□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 VPS52YDR484W 1926 nt1.6□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 YDL068WYDL068W 330 nt1.6□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 RPL31AYDL075W 342 nt1.6□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 SPC1YJR010C-A 285 nt1.6□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 AIM29YKR074W 468 nt1.6□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 COX7YMR256C 183 nt1.6□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 NOP15YNL110C 663 nt1.6□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 EGD1YPL037C 474 nt1.6□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 RTC6YPL183W-A 282 nt1.6□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 SPO24YPR036W-A 204 nt1.6□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 YBR174CYBR174C 315 nt1.6□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 LAA1YJL207C 6045 nt1.6□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 NOP53YPL146C 1368 nt1.59□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 ZRG8YER033C 3231 nt1.59□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt1.59□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.59□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.59□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.59□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.59□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.59□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.59□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.59□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 TRX1YLR043C 312 nt1.59□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 CDC33YOL139C 642 nt1.59□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt1.59□□□□□ -2.15
CSI1Q04368 RVS161YCR009C 798 nt1.58□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 YER188C-AYER188C-A 300 nt1.58□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 RPL16AYIL133C 600 nt1.58□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 YKL111CYKL111C 336 nt1.58□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 YLR269CYLR269C 351 nt1.58□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 ASM4YDL088C 1587 nt1.58□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 DCP2YNL118C 2913 nt1.58□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 SHE9YDR393W 1371 nt1.58□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 DAS1YJL149W 1992 nt1.58□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 BI2Q0110 1272 nt1.57□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 BIG1YHR101C 1008 nt1.57□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt1.57□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 YJR157WYJR157W 363 nt1.57□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 SYM1YLR251W 594 nt1.57□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 YOR248WYOR248W 303 nt1.57□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 YER135CYER135C 393 nt1.56□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 LSO2YGR169C-A 279 nt1.56□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 SEC22YLR268W 645 nt1.56□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 YML108WYML108W 318 nt1.56□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 PET127YOR017W 2403 nt1.56□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 PPN1YDR452W 2025 nt1.56□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 SKI3YPR189W 4299 nt1.55□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 HUR1YGL168W 333 nt1.55□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 YGR025WYGR025W 303 nt1.55□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 snR41snR41 95 nt1.55□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 GPX2YBR244W 489 nt1.55□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 HIR3YJR140C 4947 nt1.54□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 YHR130CYHR130C 336 nt1.54□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 RUF22RUF22 515 nt1.54□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt1.54□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 YPR039WYPR039W 336 nt1.54□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 COX1Q0045 1605 nt1.54□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 CDC24YAL041W 2565 nt1.53□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 YCR001WYCR001W 315 nt1.53□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 snR79snR79 84 nt1.53□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.53□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 CRG1YHR209W 876 nt1.53□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 YLR171WYLR171W 390 nt1.53□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 TIF11YMR260C 462 nt1.53□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 CMC2YBL059C-A 330 nt1.53□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 SPC98YNL126W 2541 nt1.53□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt1.53□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 snR13snR13 124 nt1.53□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 KAR3YPR141C 2190 nt1.53□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 SLM6YBR266C 453 nt1.53□□□□□ -2.16
CSI1Q04368 MNL2YLR057W 2550 nt1.53□□□□□ -2.17
CSI1Q04368 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.52□□□□□ -2.17
CSI1Q04368 HMI1YOL095C 2121 nt1.52□□□□□ -2.17
CSI1Q04368 YSW1YBR148W 1830 nt1.52□□□□□ -2.17
CSI1Q04368 SPC110YDR356W 2835 nt1.52□□□□□ -2.17
CSI1Q04368 TSC3YBR058C-A 243 nt1.52□□□□□ -2.17
CSI1Q04368 YGR250CYGR250C 2346 nt1.52□□□□□ -2.17
CSI1Q04368 YLR149CYLR149C 2193 nt1.52□□□□□ -2.17
CSI1Q04368 PIK1YNL267W 3201 nt1.52□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 197.9 ms