Protein–RNA interactions for Protein: Q04116

YHP1, Homeobox protein YHP1, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHP1Q04116 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.83□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 RNR4YGR180C 1038 nt0.83□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 CRG1YHR209W 876 nt0.83□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 YJL119CYJL119C 324 nt0.83□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt0.83□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 HCH1YNL281W 462 nt0.83□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 YOR364WYOR364W 369 nt0.83□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 YPL080CYPL080C 327 nt0.83□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 YPR172WYPR172W 603 nt0.83□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 UFD2YDL190C 2886 nt0.83□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 RRI2YOL117W 1938 nt0.83□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 KAR1YNL188W 1302 nt0.83□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 YJR029WYJR029W 5268 nt0.82□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.82□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 YAR009CYAR009C 3591 nt0.82□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 YDL211CYDL211C 1119 nt0.82□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 ABM1YJR108W 372 nt0.82□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 BRX1YOL077C 876 nt0.82□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 YPR146CYPR146C 330 nt0.82□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 REF2YDR195W 1602 nt0.82□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 NUP120YKL057C 3114 nt0.82□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 APL2YKL135C 2181 nt0.81□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 RAD50YNL250W 3939 nt0.81□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 EAF1YDR359C 2949 nt0.81□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 EMC5YIL027C 426 nt0.81□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 RPL37AYLR185W 267 nt0.81□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 YNL150WYNL150W 408 nt0.81□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 YNL235CYNL235C 432 nt0.81□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 SHE9YDR393W 1371 nt0.81□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 MRPL32YCR003W 552 nt0.8□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 YLL020CYLL020C 306 nt0.8□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 SPC2YML055W 537 nt0.8□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt0.8□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 ERP4YOR016C 624 nt0.8□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 TIM18YOR297C 579 nt0.8□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 MUK1YPL070W 1839 nt0.8□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 YGL217CYGL217C 342 nt0.79□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 STF2YGR008C 255 nt0.79□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt0.79□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 RPL42BYHR141C 321 nt0.79□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 RCN1YKL159C 636 nt0.79□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.79□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 YNL114CYNL114C 372 nt0.79□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 RPL42AYNL162W 321 nt0.79□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 FMP23YBR047W 528 nt0.79□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 YCL046WYCL046W 324 nt0.79□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 YBR184WYBR184W 1572 nt0.79□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 CLU1YMR012W 3834 nt0.78□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 MDM32YOR147W 1869 nt0.78□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 IES5YER092W 378 nt0.78□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 RSM27YGR215W 333 nt0.78□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 RPL40BYKR094C 387 nt0.78□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 CMS1YLR003C 876 nt0.78□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 MRPS8YMR158W 468 nt0.78□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 ATP20YPR020W 348 nt0.78□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 SLX4YLR135W 2247 nt0.78□□□□□ -2.28
YHP1Q04116 VPS54YDR027C 2670 nt0.77□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 HUG1YML058W-A 207 nt0.77□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 DDR48YMR173W 1293 nt0.77□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 SWT1YOR166C 1377 nt0.77□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 SPR3YGR059W 1539 nt0.76□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 SPC1YJR010C-A 285 nt0.76□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 YPR170CYPR170C 336 nt0.76□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 UBP3YER151C 2739 nt0.76□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 CDC24YAL041W 2565 nt0.75□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 YLL054CYLL054C 2532 nt0.75□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 CHZ1YER030W 462 nt0.75□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 MPC1YGL080W 393 nt0.75□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 YGR265WYGR265W 411 nt0.75□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 COX7YMR256C 183 nt0.75□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 VPS52YDR484W 1926 nt0.75□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 SEC3YER008C 4011 nt0.75□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 MSS11YMR164C 2277 nt0.75□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 YGL230CYGL230C 444 nt0.74□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 PAU18YLL064C 363 nt0.74□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 YLR366WYLR366W 306 nt0.74□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 YBL073WYBL073W 312 nt0.74□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 PAU6YNR076W 363 nt0.74□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt0.74□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 VAM3YOR106W 852 nt0.74□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.74□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 KAP120YPL125W 3099 nt0.74□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 SMC1YFL008W 3678 nt0.74□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 SGO1YOR073W 1773 nt0.73□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 IFH1YLR223C 3258 nt0.73□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 snR5snR5 204 nt0.73□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 snR79snR79 84 nt0.73□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 PAU2YEL049W 363 nt0.73□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 TAD1YGL243W 1203 nt0.73□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 YGR115CYGR115C 780 nt0.73□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt0.73□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 snR14snR14 160 nt0.73□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 COG4YPR105C 2586 nt0.73□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 YPR117WYPR117W 7470 nt0.73□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt0.72□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt0.72□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt0.72□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt0.72□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.72□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 YCL020WYCL020W 1317 nt0.72□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 109 ms