Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4A11Q02928 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms