Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL6Q02878 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL6Q02878 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms