Protein–RNA interactions for Protein: Q02539

HIST1H1A, Histone H1.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST1H1AQ02539 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms