Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSC2Q02487 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms