Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms