Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms