Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms