Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SMAD3P84022 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD3P84022 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD3P84022 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD3P84022 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD3P84022 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD3P84022 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD3P84022 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD3P84022 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD3P84022 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD3P84022 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD3P84022 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD3P84022 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD3P84022 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD3P84022 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD3P84022 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD3P84022 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD3P84022 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD3P84022 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD3P84022 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD3P84022 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD3P84022 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD3P84022 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD3P84022 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms