Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX3P78415 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX3P78415 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX3P78415 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX3P78415 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX3P78415 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX3P78415 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX3P78415 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX3P78415 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX3P78415 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX3P78415 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX3P78415 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX3P78415 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX3P78415 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX3P78415 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX3P78415 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX3P78415 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX3P78415 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX3P78415 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX3P78415 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX3P78415 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX3P78415 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX3P78415 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX3P78415 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX3P78415 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX3P78415 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX3P78415 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX3P78415 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX3P78415 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX3P78415 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX3P78415 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX3P78415 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX3P78415 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX3P78415 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX3P78415 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX3P78415 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX3P78415 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX3P78415 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX3P78415 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX3P78415 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX3P78415 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX3P78415 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX3P78415 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX3P78415 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX3P78415 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX3P78415 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX3P78415 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX3P78415 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IRX3P78415 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IRX3P78415 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IRX3P78415 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX3P78415 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX3P78415 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX3P78415 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX3P78415 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX3P78415 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX3P78415 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX3P78415 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX3P78415 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX3P78415 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX3P78415 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX3P78415 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX3P78415 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX3P78415 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX3P78415 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX3P78415 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX3P78415 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX3P78415 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX3P78415 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX3P78415 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX3P78415 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX3P78415 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX3P78415 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX3P78415 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX3P78415 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX3P78415 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX3P78415 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX3P78415 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX3P78415 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX3P78415 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX3P78415 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX3P78415 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX3P78415 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX3P78415 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX3P78415 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX3P78415 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX3P78415 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX3P78415 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX3P78415 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX3P78415 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX3P78415 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX3P78415 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX3P78415 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX3P78415 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX3P78415 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX3P78415 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX3P78415 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX3P78415 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX3P78415 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX3P78415 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms