Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX5P78411 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX5P78411 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX5P78411 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX5P78411 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX5P78411 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX5P78411 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX5P78411 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX5P78411 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX5P78411 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX5P78411 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX5P78411 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX5P78411 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX5P78411 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX5P78411 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRX5P78411 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX5P78411 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX5P78411 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX5P78411 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX5P78411 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX5P78411 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX5P78411 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX5P78411 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX5P78411 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX5P78411 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX5P78411 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX5P78411 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX5P78411 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX5P78411 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX5P78411 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX5P78411 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX5P78411 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX5P78411 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX5P78411 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRX5P78411 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX5P78411 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX5P78411 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX5P78411 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX5P78411 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX5P78411 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX5P78411 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX5P78411 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX5P78411 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX5P78411 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX5P78411 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX5P78411 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX5P78411 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX5P78411 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX5P78411 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX5P78411 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX5P78411 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX5P78411 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX5P78411 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX5P78411 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX5P78411 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX5P78411 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX5P78411 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX5P78411 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX5P78411 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX5P78411 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX5P78411 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX5P78411 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX5P78411 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX5P78411 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX5P78411 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX5P78411 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX5P78411 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX5P78411 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX5P78411 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX5P78411 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX5P78411 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX5P78411 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX5P78411 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX5P78411 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX5P78411 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX5P78411 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX5P78411 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX5P78411 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX5P78411 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX5P78411 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX5P78411 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX5P78411 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX5P78411 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX5P78411 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX5P78411 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX5P78411 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX5P78411 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX5P78411 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX5P78411 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX5P78411 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX5P78411 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX5P78411 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX5P78411 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX5P78411 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX5P78411 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX5P78411 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX5P78411 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX5P78411 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX5P78411 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX5P78411 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms