Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITX1P78337 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITX1P78337 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITX1P78337 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITX1P78337 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITX1P78337 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITX1P78337 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITX1P78337 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITX1P78337 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITX1P78337 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITX1P78337 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITX1P78337 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITX1P78337 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITX1P78337 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITX1P78337 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITX1P78337 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITX1P78337 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITX1P78337 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITX1P78337 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITX1P78337 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITX1P78337 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITX1P78337 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITX1P78337 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITX1P78337 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITX1P78337 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITX1P78337 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PITX1P78337 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITX1P78337 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITX1P78337 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITX1P78337 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITX1P78337 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITX1P78337 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PITX1P78337 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITX1P78337 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITX1P78337 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITX1P78337 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITX1P78337 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITX1P78337 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITX1P78337 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITX1P78337 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITX1P78337 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITX1P78337 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PITX1P78337 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PITX1P78337 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PITX1P78337 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PITX1P78337 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PITX1P78337 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PITX1P78337 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PITX1P78337 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PITX1P78337 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PITX1P78337 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PITX1P78337 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PITX1P78337 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PITX1P78337 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PITX1P78337 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PITX1P78337 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PITX1P78337 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX1P78337 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX1P78337 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX1P78337 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX1P78337 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX1P78337 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX1P78337 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX1P78337 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX1P78337 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX1P78337 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX1P78337 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX1P78337 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX1P78337 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX1P78337 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX1P78337 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX1P78337 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX1P78337 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX1P78337 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX1P78337 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX1P78337 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX1P78337 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX1P78337 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX1P78337 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX1P78337 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX1P78337 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX1P78337 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX1P78337 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX1P78337 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX1P78337 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX1P78337 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PITX1P78337 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PITX1P78337 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PITX1P78337 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PITX1P78337 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PITX1P78337 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PITX1P78337 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PITX1P78337 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PITX1P78337 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PITX1P78337 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PITX1P78337 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PITX1P78337 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PITX1P78337 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PITX1P78337 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PITX1P78337 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms