Protein–RNA interactions for Protein: P69891

HBG1, Hemoglobin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBG1P69891 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HBG1P69891 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HBG1P69891 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HBG1P69891 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HBG1P69891 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HBG1P69891 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HBG1P69891 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HBG1P69891 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HBG1P69891 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HBG1P69891 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HBG1P69891 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HBG1P69891 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HBG1P69891 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HBG1P69891 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HBG1P69891 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HBG1P69891 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HBG1P69891 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HBG1P69891 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HBG1P69891 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HBG1P69891 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HBG1P69891 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HBG1P69891 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HBG1P69891 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HBG1P69891 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HBG1P69891 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HBG1P69891 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HBG1P69891 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HBG1P69891 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HBG1P69891 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HBG1P69891 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HBG1P69891 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HBG1P69891 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HBG1P69891 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HBG1P69891 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HBG1P69891 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HBG1P69891 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HBG1P69891 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HBG1P69891 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HBG1P69891 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HBG1P69891 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HBG1P69891 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HBG1P69891 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HBG1P69891 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBG1P69891 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBG1P69891 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBG1P69891 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBG1P69891 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBG1P69891 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBG1P69891 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBG1P69891 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HBG1P69891 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBG1P69891 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBG1P69891 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBG1P69891 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HBG1P69891 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBG1P69891 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HBG1P69891 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBG1P69891 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBG1P69891 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBG1P69891 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBG1P69891 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBG1P69891 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBG1P69891 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBG1P69891 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBG1P69891 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBG1P69891 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBG1P69891 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBG1P69891 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBG1P69891 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBG1P69891 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBG1P69891 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HBG1P69891 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HBG1P69891 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HBG1P69891 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HBG1P69891 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HBG1P69891 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HBG1P69891 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HBG1P69891 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HBG1P69891 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HBG1P69891 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HBG1P69891 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HBG1P69891 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HBG1P69891 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HBG1P69891 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HBG1P69891 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HBG1P69891 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HBG1P69891 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HBG1P69891 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HBG1P69891 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HBG1P69891 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HBG1P69891 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HBG1P69891 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HBG1P69891 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HBG1P69891 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HBG1P69891 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HBG1P69891 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HBG1P69891 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HBG1P69891 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HBG1P69891 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HBG1P69891 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms