Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBP62745 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBP62745 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBP62745 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBP62745 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBP62745 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBP62745 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBP62745 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBP62745 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBP62745 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBP62745 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBP62745 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOBP62745 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBP62745 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBP62745 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBP62745 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBP62745 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBP62745 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBP62745 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBP62745 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBP62745 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBP62745 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBP62745 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBP62745 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBP62745 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBP62745 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBP62745 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBP62745 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBP62745 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBP62745 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBP62745 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBP62745 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBP62745 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBP62745 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBP62745 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBP62745 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOBP62745 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOBP62745 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOBP62745 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOBP62745 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOBP62745 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOBP62745 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOBP62745 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOBP62745 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOBP62745 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOBP62745 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOBP62745 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOBP62745 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOBP62745 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOBP62745 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOBP62745 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOBP62745 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOBP62745 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOBP62745 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOBP62745 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOBP62745 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOBP62745 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOBP62745 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOBP62745 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOBP62745 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOBP62745 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOBP62745 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOBP62745 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOBP62745 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOBP62745 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOBP62745 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOBP62745 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOBP62745 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOBP62745 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOBP62745 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOBP62745 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOBP62745 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOBP62745 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOBP62745 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOBP62745 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOBP62745 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOBP62745 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOBP62745 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOBP62745 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOBP62745 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOBP62745 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOBP62745 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOBP62745 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOBP62745 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOBP62745 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOBP62745 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOBP62745 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOBP62745 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOBP62745 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOBP62745 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOBP62745 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOBP62745 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOBP62745 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOBP62745 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOBP62745 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOBP62745 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOBP62745 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOBP62745 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOBP62745 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOBP62745 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms