Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARF6P62330 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARF6P62330 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARF6P62330 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARF6P62330 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARF6P62330 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARF6P62330 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARF6P62330 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARF6P62330 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARF6P62330 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARF6P62330 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARF6P62330 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARF6P62330 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARF6P62330 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARF6P62330 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARF6P62330 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARF6P62330 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARF6P62330 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARF6P62330 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARF6P62330 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARF6P62330 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARF6P62330 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARF6P62330 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARF6P62330 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARF6P62330 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARF6P62330 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARF6P62330 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARF6P62330 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARF6P62330 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARF6P62330 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARF6P62330 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARF6P62330 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARF6P62330 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARF6P62330 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARF6P62330 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARF6P62330 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARF6P62330 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF6P62330 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF6P62330 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF6P62330 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF6P62330 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF6P62330 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF6P62330 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF6P62330 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF6P62330 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF6P62330 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF6P62330 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF6P62330 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF6P62330 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF6P62330 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF6P62330 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF6P62330 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF6P62330 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF6P62330 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF6P62330 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF6P62330 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF6P62330 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARF6P62330 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF6P62330 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF6P62330 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF6P62330 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF6P62330 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF6P62330 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF6P62330 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF6P62330 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF6P62330 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF6P62330 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF6P62330 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF6P62330 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF6P62330 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF6P62330 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF6P62330 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF6P62330 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF6P62330 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF6P62330 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF6P62330 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF6P62330 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF6P62330 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF6P62330 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARF6P62330 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARF6P62330 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARF6P62330 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARF6P62330 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARF6P62330 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARF6P62330 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARF6P62330 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARF6P62330 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARF6P62330 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARF6P62330 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARF6P62330 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARF6P62330 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARF6P62330 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARF6P62330 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARF6P62330 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARF6P62330 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARF6P62330 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ARF6P62330 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARF6P62330 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARF6P62330 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARF6P62330 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms