Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2MP61081 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2MP61081 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2MP61081 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2MP61081 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2MP61081 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2MP61081 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2MP61081 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2MP61081 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2MP61081 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2MP61081 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2MP61081 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2MP61081 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2MP61081 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2MP61081 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2MP61081 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2MP61081 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2MP61081 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2MP61081 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2MP61081 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2MP61081 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2MP61081 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2MP61081 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2MP61081 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2MP61081 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms