Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms