Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDL3P58872 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms