Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NME5P56597 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NME5P56597 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NME5P56597 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NME5P56597 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NME5P56597 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NME5P56597 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NME5P56597 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NME5P56597 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NME5P56597 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NME5P56597 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NME5P56597 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NME5P56597 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NME5P56597 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NME5P56597 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NME5P56597 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NME5P56597 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NME5P56597 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NME5P56597 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NME5P56597 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NME5P56597 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NME5P56597 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NME5P56597 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NME5P56597 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NME5P56597 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NME5P56597 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NME5P56597 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NME5P56597 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NME5P56597 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NME5P56597 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NME5P56597 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NME5P56597 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NME5P56597 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NME5P56597 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NME5P56597 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NME5P56597 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NME5P56597 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME5P56597 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME5P56597 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME5P56597 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME5P56597 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME5P56597 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME5P56597 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME5P56597 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME5P56597 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME5P56597 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME5P56597 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME5P56597 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME5P56597 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NME5P56597 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME5P56597 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME5P56597 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME5P56597 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME5P56597 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME5P56597 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME5P56597 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME5P56597 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME5P56597 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME5P56597 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NME5P56597 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NME5P56597 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NME5P56597 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NME5P56597 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NME5P56597 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NME5P56597 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NME5P56597 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NME5P56597 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NME5P56597 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NME5P56597 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NME5P56597 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NME5P56597 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NME5P56597 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NME5P56597 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NME5P56597 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NME5P56597 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NME5P56597 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NME5P56597 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NME5P56597 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NME5P56597 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NME5P56597 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NME5P56597 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NME5P56597 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NME5P56597 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NME5P56597 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NME5P56597 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NME5P56597 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NME5P56597 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NME5P56597 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NME5P56597 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NME5P56597 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NME5P56597 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NME5P56597 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NME5P56597 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NME5P56597 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NME5P56597 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NME5P56597 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NME5P56597 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NME5P56597 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NME5P56597 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NME5P56597 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms