Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAV3P56539 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAV3P56539 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAV3P56539 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAV3P56539 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CAV3P56539 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CAV3P56539 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAV3P56539 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAV3P56539 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CAV3P56539 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAV3P56539 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAV3P56539 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAV3P56539 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAV3P56539 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CAV3P56539 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAV3P56539 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CAV3P56539 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CAV3P56539 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAV3P56539 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAV3P56539 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAV3P56539 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CAV3P56539 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CAV3P56539 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAV3P56539 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CAV3P56539 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAV3P56539 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAV3P56539 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAV3P56539 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAV3P56539 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAV3P56539 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAV3P56539 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAV3P56539 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAV3P56539 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAV3P56539 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAV3P56539 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAV3P56539 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAV3P56539 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CAV3P56539 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAV3P56539 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAV3P56539 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAV3P56539 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAV3P56539 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAV3P56539 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAV3P56539 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAV3P56539 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAV3P56539 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAV3P56539 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAV3P56539 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAV3P56539 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAV3P56539 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAV3P56539 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAV3P56539 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAV3P56539 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAV3P56539 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAV3P56539 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAV3P56539 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAV3P56539 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAV3P56539 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAV3P56539 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAV3P56539 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAV3P56539 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAV3P56539 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAV3P56539 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CAV3P56539 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAV3P56539 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAV3P56539 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAV3P56539 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAV3P56539 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAV3P56539 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAV3P56539 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAV3P56539 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAV3P56539 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAV3P56539 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAV3P56539 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CAV3P56539 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAV3P56539 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAV3P56539 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAV3P56539 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAV3P56539 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAV3P56539 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAV3P56539 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAV3P56539 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAV3P56539 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAV3P56539 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAV3P56539 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAV3P56539 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAV3P56539 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAV3P56539 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAV3P56539 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAV3P56539 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAV3P56539 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAV3P56539 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAV3P56539 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAV3P56539 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAV3P56539 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAV3P56539 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAV3P56539 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAV3P56539 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAV3P56539 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAV3P56539 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms