Protein–RNA interactions for Protein: P56385

ATP5I, ATP synthase subunit e, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5IP56385 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5IP56385 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5IP56385 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms