Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP1P56182 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP1P56182 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP1P56182 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP1P56182 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP1P56182 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP1P56182 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP1P56182 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP1P56182 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP1P56182 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP1P56182 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP1P56182 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP1P56182 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP1P56182 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRP1P56182 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP1P56182 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP1P56182 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP1P56182 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP1P56182 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP1P56182 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP1P56182 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP1P56182 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP1P56182 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP1P56182 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP1P56182 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP1P56182 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP1P56182 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP1P56182 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP1P56182 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP1P56182 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP1P56182 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP1P56182 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP1P56182 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP1P56182 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP1P56182 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP1P56182 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP1P56182 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP1P56182 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP1P56182 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP1P56182 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP1P56182 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP1P56182 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP1P56182 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP1P56182 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP1P56182 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP1P56182 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP1P56182 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP1P56182 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP1P56182 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP1P56182 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP1P56182 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP1P56182 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP1P56182 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP1P56182 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP1P56182 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP1P56182 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP1P56182 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP1P56182 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP1P56182 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP1P56182 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRP1P56182 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP1P56182 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP1P56182 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP1P56182 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP1P56182 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP1P56182 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP1P56182 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP1P56182 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP1P56182 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP1P56182 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP1P56182 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP1P56182 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP1P56182 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP1P56182 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP1P56182 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP1P56182 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP1P56182 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP1P56182 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP1P56182 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP1P56182 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP1P56182 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP1P56182 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP1P56182 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP1P56182 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP1P56182 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP1P56182 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP1P56182 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP1P56182 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP1P56182 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP1P56182 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP1P56182 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP1P56182 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP1P56182 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP1P56182 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP1P56182 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP1P56182 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP1P56182 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP1P56182 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP1P56182 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP1P56182 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms