Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP7P55210 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP7P55210 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP7P55210 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP7P55210 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP7P55210 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP7P55210 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP7P55210 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP7P55210 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP7P55210 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP7P55210 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP7P55210 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP7P55210 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP7P55210 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP7P55210 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP7P55210 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP7P55210 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP7P55210 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP7P55210 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP7P55210 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP7P55210 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP7P55210 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP7P55210 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP7P55210 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP7P55210 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP7P55210 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP7P55210 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP7P55210 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP7P55210 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP7P55210 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP7P55210 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP7P55210 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP7P55210 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP7P55210 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP7P55210 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP7P55210 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP7P55210 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP7P55210 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP7P55210 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP7P55210 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP7P55210 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP7P55210 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP7P55210 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP7P55210 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP7P55210 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP7P55210 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP7P55210 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP7P55210 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP7P55210 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP7P55210 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP7P55210 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP7P55210 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP7P55210 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP7P55210 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP7P55210 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP7P55210 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP7P55210 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP7P55210 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP7P55210 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP7P55210 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP7P55210 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP7P55210 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP7P55210 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP7P55210 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP7P55210 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP7P55210 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP7P55210 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP7P55210 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP7P55210 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP7P55210 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP7P55210 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP7P55210 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP7P55210 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP7P55210 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP7P55210 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP7P55210 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP7P55210 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP7P55210 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP7P55210 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP7P55210 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP7P55210 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP7P55210 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP7P55210 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP7P55210 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP7P55210 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP7P55210 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP7P55210 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP7P55210 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP7P55210 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP7P55210 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP7P55210 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP7P55210 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP7P55210 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CASP7P55210 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CASP7P55210 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASP7P55210 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASP7P55210 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CASP7P55210 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASP7P55210 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASP7P55210 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms